Nintendo 3DS:n latauspalvelu ei ole saatavilla vielä konsolin julkaisupäivänä. Toiminto pyritään lisäämään konsolin ensimmäisen ohjelmistopäivityksen yhteydessä toukokuun lopulla. Yhtiön pääjohtaja Satoru Iwata selvensi tulevan eShop-palvelun julkaisuajankohtaa Nintendon osavuosikatsauksen jälkeisessä tiedotustilaisuudessa.
Nintendo eShopin Virtual Console -osiossa aiotaan myydä vanhojen konsolien pelejä. Lisäksi palvelu sisältää DSiWare-alueen erityisesti 3DS:lle kehitettyjä ladattavia pelejä varten ja 3D Classics -nimisen osion, jossa luvataan tarjota klassikkopelejä uudella 3D-kuorrutuksella. Saataville tulee myös esittelyvideoita ja ilmaisia kokeiluversioita peleistä.
Ensimmäisen laitteistopäivityksen yhteydessä käytettäviksi tulevat myös verkkoselain ja mahdollisuus siirtää DSiWare-palvelusta DSi-konsoliin ladatut tuotteet 3DS:ään.