Nintendon 3DS-käsikonsolille julkaistaan ensi kuun loppupuolella latauspalvelu pelejä ja sovelluksia varten. eShop-nimeä kantava palvelu jaellaan konsoleille osana järjestelmäpäivitystä. Ladattavaksi on tulossa muun muassa 3D Classics -nimikkeen alla julkaistavia pelejä, jotka ovat Nintendon klassikkopelejä, muutettuna 3D-muotoon.
Ensimmäinen kolmiulotteinen klassikko eShopissa on Excite Bike, joka ainakin Japanissa on pelaajien ladattavissa ilmaiseksi latauspalvelun julkistuksen yhteydessä. 3DS:n Virtual Console -tarjonta keskittyy alkuun Game Boy- ja Game Boy Color -peleihin, mutta Nintendon pyrkimyksenä on laajentaa konsolikirjoa myöhemmin koskemaan myös muita laitteita.
eShop-valikoimaan on tulossa DSi:n Flipnote Studio -ohjelman päivitetty versio, Flipnote Memo. Nintendon suunnitelmien mukaan sovelluksessa tehdyt tuotokset voi jakaa muille 3DS-käyttäjille, joskin huolta aiheuttaa vääränlaisen sisällön joutuminen lasten nähtäville. Sovelluksen voi ladata palvelusta aikanaan ilmaiseksi.